锦鲤鱼苗很难管理，一不小心，就会影响锦鲤鱼苗的生长发育。给锦鲤鱼苗遮挡阳光、每天的巡塘，关注锦鲤鱼苗的摄食情况，都是必须要做的事情。
幼小的锦鲤鱼苗害怕阳光的直接照射，他们具有群集的特性，所以池塘水质需有一定的肥度，透明度不宜过大，否则应在池塘深水处设置面积5～10平方米的遮盖物(遮阳布、竹席、芦苇、石棉瓦等)。

锦鲤鱼苗的管理
锦鲤鱼苗有钻越孔穴缝隙的习性，若出水口栅栏不严或锦鲤鱼池有破损漏洞，锦鲤鱼苗就会从此处逃逸。红白锦鲤整个苗种阶段都有集群的特性，光照越强，集群程度越高，有时整池的锦鲤鱼苗完全集中于1～2团，头向内、尾朝外不安地向鱼群底部挤钻;在光照适宜、食物充足的环境里，锦鲤鱼苗大都集合成小团，分布亦较均匀，受到惊扰时只是稍微散开一下，接着又安静下来。锦鲤苗种池的溶氧量一般应维持在5毫克/升以上，否则易发生浮头、泛池事故。

锦鲤鱼苗培育池的施肥应坚持“基肥要充足，追肥要及时”的原则。锦鲤鱼苗下塘后应密切注意池塘水质状况，及时少量勤施追肥，保持池中有一定量的天然饵料供锦鲤鱼苗摄食。锦鲤鱼苗下塘时，的透明度在30厘米以上时，每667平方米追施猪粪或人粪150～250千克。一般每天每667平方米施50～100千克猪粪或人粪，以保持水的肥度。当水质过肥时，则要加注新水，使池水的透明度保持在25厘米左右。阴雨天不施肥，否则可能造成锦鲤池水缺氧。

每天巡塘管理时，都要注意锦鲤鱼苗摄食与分布状况。试验表明，在水温25℃～28℃、体长2 ～3厘米的情况下，光照强度在150 ～300勒时锦鲤苗种的日摄食量**，平均可达鱼体重的20%左右。锦鲤鱼苗白天一般不做远距离游动，喜集群于池壁凹陷处或躲在池底石块、池边的陆草等物的背阴处，悠闲地摆动其尾。夜晚则分散于整个水体四处悠然游动，每天清晨与黄昏是它们活动高峰期。